سقاخانه‏ي مشهور ديگري که در اينجا از آن ياد مي‏شود؛ در داخل صحن [ صفحه 206] مسجد جامع تهران قرار دارد. اين سقاخانه که آن را مي‏توان از نوع سقاخانه‏هاي مستقل ياد کرد، شامل بناي مکعب شکل سنگي است، که در چهار گوشه خود، ستون‏هايي سنگي دارد. اين ستون‏ها به گونه‏اي تعبيه شده‏اند که در پايين هر وجه بنا، شير گاو و در بالا پنجره مشبک آهنيني را حفاظت مي‏کنند. روي شبکه فلزي پنجره‏هاي هر وجه بنا، عبارت «سلام بر حسين و لعنت بر يزيد» با خط زيبايي نصب شده است. البته ضلع چهارم اين سقاخانه به ديوار مسجد تکيه دارد ولي چندان وابسته به آن به نظر نمي‏رسد، همين وضعيت آبخوري ضلع چهارم آن را در صورت موجود بودن غير قابل بهره‏برداري کرده است. زمان ساخت اين سقاخانه نيز به طور دقيق مشخص نيست. به دلايل نامعلومي از حدود 20 سال سقاخانه بسته شده و اخيرا در حدود يک سالي است که بهره‏برداري از آن دوباره آغاز شده است. توليت فعلي سقاخانه با شخصي از معتمدين محلي است که از سوي سازمان اوقاف تهران، اين مسئوليت و نيز توليت مسجد به وي تفويض شده است.