در وسط بقعه ضريحي است مشبک از چوب رنگين به رنگ سبز که لب آن از بالا قاب‏بندي و تنکه‏سازي گرديده و در پرده‏اي از حرير سبزرنگ پوشانده شده است. درون آن مرقدي است به ارتفاع 20 / 1، طول 2 و عرض 50 / 1 متر که بدنه‏ي آن از پنج جهت آراسته به کاشيهاي خشتي منقش هفت‏رنگ عصر فتحعلي‏شاه مي‏باشد. سطح مرقد از چهار جانب داراي حاشيه است در وسط دو رديف کاشيها دوالي از خشتهاي کاشي 20 ضربدر 40 منقش هفت رنگ که روي خشتهاي طرف بالاي سر کتيبه‏اي [ صفحه 201] است به خط ثلثي نسخ طلايي در زمينه‏ي لاجوردي متضمن نسب‏نامه‏ي امامزاده با همان اسقاطات، بدين عبارت: هذا المرقد المنور و المضجع المطهر امامزاده واجب التعظيم و التکريم امامزاده السيد علي عليه‏السلام بن ابراهيم بن جعفر بن عباس بن امام المتقين علي و اميرالمؤمنين حيدر بن ابي‏طالب صلوات الله عليهم اجمعين.